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云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所（以下简称“生物所”）建于2004年6月，其前身是创建于1986年的云南省遗传工程研究室（“遗传室”）、云南省农业科学院分析测试中心（“测试中心”），以及1988年建立的云南省农业科学院品种资源站（“品资站”）。1992年，遗传室与测试中心合并成立云南省农业科学院生物技术研究所，同年，经云南省人民政府批准，依托云南省农业科学院，在所内建设云南省农业生物技术重点实验室，1994年建成并通过验收，是我国地方农科院系统最早成立的农业生物技术研究机构之一。